UNIVERZITET U TUZLI
PRIRODNO-MATEMATIČKI FAKULTET
Tuzla, 03.02.2025. godina
Na osnovu člana 18. Pravilnika o završnom magistarskom radu na II ciklusu studija Univerziteta u Tuzli, Sekretarijat Univerziteta
O B J A V L J U J E
Amela Jusufović, bachelor primijenjene biologije javno će braniti završni magistarski rad, pod naslovom „Aplikacija DNK metabarkodiranja dijatomeja u biološkom monitoringu rijeke Une“ u petak 21.02.2025. godine u Sali broj: 211 Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Tuzli, sa početkom u 14 sati pred Komisijom u sastavu:
- Dr sc. Adisa Ahmić, redovni profesor, predsjednik komisije
Uža naučna oblast: Genetika, biologija ćelije i mikrobiologija
Prirodno-matematički fakultet, Univerzitet u Tuzli
- Dr sc. Jasmina Kamberović, vanredni profesor, mentor i član
Uža naučna oblast: Ekologija biljaka i životinja
Prirodno-matematički fakultet, Univerzitet u Tuzli
- Dr sc. Elvira Hadžiahmetović Jurida, redovni profesor, član
uža naučna oblast: Ekologija biljaka i životinja
Prirodno-matematički fakultet, Univerzitet u Tuzli
Za zamjenika jednog od članova Komisije imenuje se dr.sci. Edina Hajdarević, redovni profesor za užu naučnu oblast „Biosistematika i morfologija životinja“ Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Tuzli.
Pristup javnosti je slobodan.
Magistarski rad se može pogledati u Sekretarijatu Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Tuzli, radnim danom od 8,00 do 16,00 sati.
REZIME RADA
Alge kao indikatori promjena u vodenoj sredini su najzastupljeniji i obavezni dio monitoringa površinskih voda u Evropskoj uniji i Bosni i Hercegovini. Odlukom o karakterizaciji površinskih i podzemnih voda, referentnim uslovima i parametrima za ocjenu stanja voda i monitoringu voda Federacije Bosne i Hercegovine, fitobentoski organizmi su predviđeni kao indikatori kvaliteta vode, a poseban značaj imaju vrste bentosnih algi, odnosno dijatomeje. Dosadašnji klasični pristup putem mikroskopske analize dijatomeja i utvrđivanje njihovog diverziteta pokazao se kao dugotrajan, pa se u zadnje dvije decenije intenzivno radilo na pronalasku novih tehnologija u analizi biodiverziteta ovih organizama.
Ciljevi istraživanja ovog rada su optimizirati protokol za izolaciju i amplifikaciju DNK materijala iz fitobentoskih uzoraka sa sedrene podloge, identificirati bentoske zajednice dijatomeja na sedrenim slapovima primjenom metode metabarkodiranja okolišne DNK, analizirati diverzitet dijatomeja rijeke Une na longitudinalnom profilu i ispitati primjenjivost DNK metabarkodiranja bentoskih dijatomeja u određivanju ocjene ekološkog stanja rijeke Une.
Terenska straživanja obuhvatila su uzorkovanje sedrenih naslaga na slapovima rijeke Une, ukupno 8 lokaliteta, i to slapovi Martin Brod, Štrbački buk, Troslap, Dvoslap, Ripač, Kostela, Bosanska Krupa i Bosanska Otoka. Nakon uzorkovanja i izolacije DNK iz uzoraka, tehnologijom HTS sekvencioniranja na rbcL genskoj regiji i korištenjem referentne baze podataka, utvrđeno je prisustvo 32 roda i 58 taksona dijatomeja na nivou vrste ili podvrste sa 333 319 očitanja unutar 265 amplikonskih sekvencijskih varijanti (ASV).
Najzastupljeniji taksoni na lokacijama utvrđeni su kako slijedi: na Martin Brodu Encyonema spp., Nitzschia dissipata var. media, Navicula cryptotenella, na Štrbačkom buku Achnanthidium minutissimum, Navicula cryptotenella i Amphora pediculus, na Troslapu Nitzschia dissipata var. media i Achnanthidium minutissimum, na Dvoslapu Encyonema spp. i Diatoma vulgaris, u Ripaču Navicula cryptotenella i Nitzschia spp., u Kostelu Navicula cryptotenella, Amphora pediculus i Fragilaria sp., u Bosanskoj Krupi Nitzschia dissipata var. media, Ulnaria ulna i Encyonema, u Bosanskoj Otoci Fragilaria sp. i Nitzschia dissipata var. media. Vrste Navicula tripunctata, Ellerbeckia sp., Gomphonema tergestinum, Nitzschia fonticola imale su relativno ujednačenu brojnost duž rijeke.
U radu je predočena i uporedba sa morfološko-taksonomskom analizom zajednica na sedrotvornim barijerama rijeke Une iz ranijih studija. Rezultati istraživanja pokazali su da kombinirani pristup (morfološki i molekularni) u identifikaciji taksona doprinosi kvalitetnoj informaciji o alfa diverzitetu sedrotvornih formacija krških rijeka, utvrđen je optimizirani protokol za izolaciju DNK iz uzoraka fitobentosa sedrenih barijera rijeke Une i aplicirana je metoda okolišnog DNK metabarkodiranja bentosnih dijatomeja u ocjeni ekološkog statusa rijeke Une.
Ključne riječi: Una, krške rijeke, sedra, dijatomeje, DNK metabarkodiranje, diverzitet.